桂林CNV-seq 染色体异常检测(通用版)
适用人群
CNV-seq低深度全基因组测序,以100kb分辨率检测染色体非整倍体及微缺失微重复,5个工作日出具报告,价格2100元。
适用人群
- 复发性流产患者,需明确流产物染色体异常比例,指导再生育方案
- NIPT高风险的孕妇,需羊水穿刺后进行染色体诊断性确认
- 超声提示胎儿结构异常的孕妇,需排除微缺失/微重复综合征
- 不明原因智力发育迟缓或自闭症儿童,需评估遗传病因
- 高龄孕妇(≥35岁)选择产前诊断,替代或补充传统核型
- 多发畸形或癫痫患儿,需全基因组CNV扫描寻找致病片段
检测内容
本检测采用低深度全基因组测序(CNV-seq),测序深度为1×,以GRCh37/hg19为参考基因组,通过高通量测序平台对样本DNA进行超声打断、文库构建和测序,经内部生物信息平台比对与注释,检测全基因组范围内100kb及以上的拷贝数变异(CNV)。能发现染色体非整倍体(如21、18、13三体及性染色体异常)、微缺失/微重复综合征(如DiGeorge、Williams、Prader-Willi等),以及流产物中的染色体异常(如15三体占早期流产的1.68%)。与传统核型(分辨率5–10Mb)相比,本检测分辨率达100kb–1Mb,且无需细胞培养,5个工作日即可出具报告。与CMA芯片相比,结果相似但技术更新、速度更快。不能检测多倍体(三倍体、四倍体)、单亲二倍体、平衡易位、倒位、环状染色体、嵌合体、100kb以下缺失/重复,以及高度重复或固缩区域(如近着丝粒、端粒区域)的变异,也不检测点突变或小片段插入缺失。参考数据库包括UCSC、DGV、OMIM、DECIPHER、PubMed和ISCA,变异分类严格遵循国际标准。
检测流程
样本类型灵活,包括外周血(EDTA抗凝血≥2mL)、羊水、绒毛、流产物,以及提取的DNA(≥1μg)。无需空腹,不受饮食影响。在桂林本地可预约上门采样或前往合作医疗机构,流产物样本建议清宫术中或自然排出后立即采集绒毛组织,24小时内送检。支持全国邮寄,样本冷藏运输(4℃)即可,方便快捷。
准确性说明
技术基于高通量测序平台,数据经内部生物信息流程严格质控,确保所有出具变异均有高质量数据支持。变异解读依托六大国际数据库(UCSC、DGV、OMIM、DECIPHER、PubMed、ISCA),按ACMG/ClinGen指南分类为致病、可能致病、临床意义未明、可能良性、良性。阳性结果(如检出致病性CNV)可在5个工作日内明确诊断,指导临床干预或再生育咨询;阴性结果需结合临床表型综合判断,因检测局限性(如无法检出平衡易位、多倍体、单亲二倍体)不能完全排除遗传病因。临床意义未明变异建议父母针对性检测以辅助解读。假阳性可能发生于长重复序列、GC含量高等区域,报告已排除这些区域数据,必要时可联合核型或CMA复核。
详细流程
- 咨询与知情:在桂林门店或在线预约,由专业人员评估适用性并签署知情同意书
- 样本采集:根据需求采集外周血2mL(EDTA抗凝)或流产物绒毛/羊水/组织样本
- 样本寄送:样本于4℃冷藏运输至实验室,24小时内送达
- DNA提取与质检:从样本中提取基因组DNA,评估纯度与浓度
- 文库构建:通过超声打断DNA,制备测序文库
- 高通量测序:在测序平台上以1×深度进行全基因组测序
- 生物信息分析:数据比对至GRCh37/hg19,经内部流程检测CNV并注释
- 报告出具:5个自然日内生成报告,包含变异坐标、大小、分类及临床意义解读,由遗传咨询师解读结果
检测须知
- 本检测仅适用于100kb及以上CNV,无法检测点突变、小片段缺失/重复及平衡易位
- 流产物样本需避免母体血液污染,建议清宫术中或排出后立即采集绒毛
- 检测结果需结合临床表型综合判断,阴性结果不能完全排除染色体病因
- 临床意义未明变异可能随科学进展重新分类,建议定期随访
- 高度重复序列、GC含量高区域可能存在假阳性,报告已排除相关区域
- 本检测不用于筛查或诊断多倍体、单亲二倍体、嵌合体及罗氏易位
- 样本运输需冷藏(4℃),避免反复冻融
- 报告周期为5个自然日,从实验室收到合格样本起算
桂林可做此检测的机构
常见问题
Q: 我在桂林,流产物已经用福尔马林泡过了,还能做CNV-seq吗?
A: 不能。福尔马林固定会严重降解DNA,导致无法提取足量(≥1μg)的高质量基因组DNA进行文库构建。本检测要求新鲜绒毛或EDTA抗凝外周血样本。如果组织已固定,建议联系送检机构确认是否可改用其他检测方法(如FISH),或下次妊娠再行产前诊断。
Q: CNV-seq能检测到‘染色体平衡易位’吗?
A: 不能。原报告明确列出本检测局限性:不检测染色体平衡易位、倒位、环状等结构重排。这些变异不改变染色体片段拷贝数,CNV-seq(低深度全基因组测序)无法检出。如临床怀疑平衡易位,需结合传统核型分析(需细胞培养,分辨率5–10 Mb)评估。
Q: 我在桂林,报告说‘非整倍体变异0个’,但流产物样本检测结果正常,为什么还会流产?
A: 流产原因复杂,染色体异常只是其中之一。即使CNV-seq未检出异常,仍可能有其他因素:如单基因病、多倍体(本检测无法检出)、母体免疫或内分泌问题、解剖异常、感染等。另外,约30-50%的早期流产原因不明。CNV-seq针对≥100kb的拷贝数变异,不检测单亲二倍体、平衡易位等,建议结合临床进一步排查。
Q: 报告显示15号染色体三体,我下次怀孕还会发生吗?
A: 15号染色体三体多为新发突变,复发风险通常低于1%,但若父母存在嵌合体或平衡易位,复发风险会升高。原报告明确15三体占早期自然流产的1.68%。建议夫妻双方做外周血核型分析排除易位携带,下次怀孕可考虑产前诊断(羊水CNV-seq+核型)或胚胎植入前遗传学检测(PGT-A)。
Q: 报告解读后,我想找遗传咨询师再聊聊,怎么约?
A: 报告出具后,您可致电客服预约遗传咨询师进行电话或视频解读,费用包含在检测服务中。咨询师会结合您的临床表型和家族史,详细说明CNV结果的临床意义,尤其对“临床意义未明变异”会给出后续建议(如父母验证检测)。建议提前整理好问题清单。